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国内首个儿童遗传性肾脏病数据库网站上线 “基因检测+大数据”助力精准诊断
2024-11-14 21:44

  儿童遗传性肾病是一种较为罕见的儿科疾病,可导致儿童肾衰竭,甚至尿毒症的发生,使患儿及父母承受巨大的痛苦。尽管多年来肾脏替代治疗(RRT)的应用拯救了大量遗传性肾病患者的生命,但肾脏替代疗法也极大地降低了他们的生活质量,同时开支巨大。

国内首个儿童遗传性肾脏病数据库网站上线  “基因检测+大数据”助力精准诊断

  更为重要的是, 由于遗传学病因不明确、生物学标志物缺乏,每个患儿的致病基因、身体状况千差万别,对于临床上的个体化诊治提出了极高挑战。虽然基因检测也成为了治疗中的标配,复旦儿科等国内一批顶级医院在治疗方面也取得了长足进步,但国内大部分儿科及儿童肾脏病工作者还缺乏分子水平检测和对疑难罕见的肾脏疾病从表型和基因型的科学全面认识。

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  单木难成林,一花独放不是春,怎么办?

  9月15日,复旦大学附属儿科医院宣布,由复旦大学附属儿科医院(国家儿童医学中心)徐虹教授和上海市医学会医学遗传学专业委员会主委马端教授牵头共建,联合首都医科大学附属北京儿童医院(国家儿童医学中心)等全国多家儿童医院共同设计开发的“中国儿童遗传性肾脏疾病数据库”网站(www.ccgkdd.com.cn)正式上线。

  上海市肾脏发育和儿童肾脏病研究中心主任、中国医师协会儿科医师分会肾脏专委会主任委员、复旦大学附属儿科医院徐虹教授表示:作为国内首个儿童遗传性肾病疾病数据库,将为临床医生准确判断患儿病情,实现儿童遗传性肾病精准诊断提供大数据支持,同时也将推动不同疾病的表型谱和基因突变谱、探索新的致病基因和精准治疗方案。目前平台数据库已收集最新的遗传性肾脏疾病425种、表型1465种,基因327个、相关变异1216条,登记病例45例,随着网站上线开放,数据库病例数还将不断增加。

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  “基因诊断+大数据” 助力复杂病情精准诊断

  共建单位之一、首都医科大学附属北京儿童医院肾病科陈植教授在谈及该数据库的意义时表示:遗传性肾病对于激素和免疫抑制剂耐药,预后差,是所有肾病科专家面临的共同难题,基于基因检测进行的个体化诊疗有助于延缓疾病进展,保护患儿肾功能,避免盲目治疗,而该数据库的建成将进一步促进国内相关学科合作,打破地域限制,推进案例共享,促进相关学科的共同提升,意义十分巨大。

  复旦大学附属儿科医院分享的病例显示:住院患儿付付10月龄开始出现大量蛋白尿伴低白蛋白血症,并伴有先天性心脏病、生长发育落后和大脑萎缩等表现,临床上考虑先天性肾病综合征。对其进行全外显子组测序后发现患儿为COQ6基因突变,分别来源父母所携带的变异,确诊为COQ6基因突变所致线粒体相关肾病。基因诊断明确后选择针对代谢缺陷的辅酶Q10进行补充,随访3个月后付付的尿蛋白完全缓解,肾功能正常,精神运动发育状态改善。徐虹教授欣慰地表示,“基因检测使该患儿得到精准诊断和治疗,避免不必要的过度治疗,改善了预后。”

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  推动疾病诊断标准化

  据中华医学会医学遗传学分会副主委、中国医师协会医学遗传分会临床遗传学专委会副主委、上海市医学会医学遗传学专委会主任委员马端教授介绍,虽然基因诊断技术在儿童肾脏疾病中逐步开展,但尚缺乏中国人群中儿童遗传性肾脏疾病发病率、疾病分布及致病基因的大宗数据报道,广大儿科及儿童肾脏病工作者对一些疑难罕见的肾脏疾病缺乏从表型和基因型的科学全面认识。

  在当今的大数据时代背景下,国际遗传学界越来越多的研究者开始应用网络数据平台,以分享二代测序在儿童罕见病及遗传性疾病中的基因突变发现,从公开的网络数据分享中获得更多的合作和对疾病的进一步认识。为了提高儿童遗传性肾脏疾病的临床诊疗水平,推进实验室对儿童遗传性肾脏疾病的机制研究,复旦大学附属儿科医院(国家儿童医学中心)和上海市医学会医学遗传学专业委员会牵头,由中科基因和北京智因东方转化医学研究中心提供有力的技术支持,共同设计开发“中国儿童遗传性肾脏疾病数据库”网站。

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  据悉,该网站主要由遗传性肾脏病库、肾脏病基因库、病例档案库、治疗方案库、在线数据分析平台以及病例论坛、专家述评&电子论文等模块构成。

  目前,平台数据库已收集最新的遗传性肾脏疾病425种、表型1465种,基因327个、相关变异1216条,登记病例45例,随着网站上线开放,数据库病例数将不断增加。该平台还将推出“全国儿童尿毒症致病基因研究助力计划”,为来自全国的病因不明或需进一步明确基因诊断的尿毒症患儿及家系标本进行基因检测、数据解读及数据登记录入等,有效建立中国儿童尿毒症临床-分子遗传学精准诊断体系,同时也将利用新媒体方式定期举办临床-病理-基因等多学科讨论会,并进行在线网络直播,进一步推动全国儿童肾脏疾病基因诊断水平。

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  徐虹教授透露,这一平台以国家儿童医学中心为使命,整合了京沪等多地儿童专科医院及三级甲等医院儿科资源,收集儿童遗传性肾脏疾病病例的临床资料和基因变异数据,从而形成中国儿童群体遗传性肾脏疾病数据库。该数据库也将为患儿带来切实的福音。

  今后,儿科医生、遗传病工作者可通过数据库查询遗传性肾病发病率、临床表现、致病基因及治疗进展,患儿家属也可通过该网站了解儿童遗传性肾脏病科普知识。

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  这一平台除了为临床提供大数据支持外,更重要的是有助于开展进一步医学研究,提高诊疗水平。今后将通过生物信息学手段对登记病例二代测序原始数据进行整合、筛选和分析,与表型、治疗方案进行关联分析,以期扩展不同疾病的表型谱和基因突变谱、探索新的致病基因,通过“精准治疗方案”让更多患者受益。

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